Esta nueva tecnología, fruto de la colaboración con la Universidad de Milán-Bicocca (Italia) y la Yale School of Medicine (USA), genera mapas detallados que revelan cómo las células tumorales obtienen energía y nutrientes según su ubicación. El estudio ha sido publicado en la revista Systems biology and applications.
Los tumores son ecosistemas complejos donde cada célula cancerosa juega un rol definido por su expresión génica. La secuenciación espacial ya había permitido localizar estas células y sus expresiones génicas. Ahora, el método spatial Flux Balance Analysis (spFBA) va un paso más allá, integrando esta información genética para inferir la actividad metabólica, como el crecimiento, la supervivencia y la expansión celular.
“Nuestro objetivo era entender cómo influye el lugar que ocupa cada célula dentro del tumor en su manera de obtener energía y nutrientes”, explica el Dr. Davide Maspero, investigador del CNAG y autor principal del estudio. “Ahora podemos integrar la expresión de sus genes para inferir su actividad metabólica, como el crecimiento, la supervivencia y la expansión celular”.
Los mapas metabólicos resultantes muestran, por ejemplo, qué regiones tumorales consumen más glucólisis para obtener energía, cuáles destinan más recursos a la producción de biomasa o cuáles liberan lactato. Esta información es crucial para entender las estrategias de proliferación, evasión inmunitaria y metástasis, abriendo la puerta a futuras terapias más dirigidas.
Los primeros análisis se han centrado en cáncer colorrectal y renal. En el caso del cáncer colorrectal, los mapas revelaron una red de cooperación metabólica entre diferentes regiones del tumor, donde unas producen lactato y otras lo consumen para fabricar biomasa tumoral. En el cáncer de riñón, se confirmó la heterogeneidad del fenotipo de Warburg, con regiones que producían lactato incluso con oxígeno presente.
El equipo ya trabaja en una nueva versión del programa spFBA para ampliar su compatibilidad con más bases de datos de transcriptómica espacial, facilitando así su adopción por otros centros de investigación y hospitales.
