El profesor Rodolfo Cortés inició su trayectoria como docente de Arqueología en la Universitat de Barcelona (UB) en octubre de 1974, adscribiéndose posteriormente a la Universitat Rovira i Virgili (URV) en julio de 1992. Junto con el arqueólogo Eudald Carbonell, en el año 1988 fundaron el Laboratorio de Arqueología de la UB en Tarragona (LAUBT), que combinaba la prehistoria y la arqueología clásica.

Esta iniciativa se transformó con la creación de la URV, convirtiéndose en el Laboratorio de Arqueología de la Universitat de Tarragona (LAUT), precursor del actual Institut Català de Paleoecologia Humana i Evolució Social (IPHES-CERCA). Cortés dirigió el Servicio Arqueológico de la Universidad desde 1994 hasta 2002, convirtiéndolo en un centro de formación esencial para los futuros arqueólogos de la región.

Entre los hitos más destacados de su etapa, en 1995, Cortés y Carbonell anunciaron el hallazgo de los primeros restos arqueológicos, de un millón de años de antigüedad, en el Barranc de la Boella, en el término de La Canonja, puestos al descubierto por las lluvias. Además, fue uno de los grandes expertos en el patrimonio de Tarraco.

Durante su dirección, se impulsaron excavaciones cruciales en la ciudad de Tarragona, como las realizadas en la Plaça de la Font para la construcción del aparcamiento actual, que afectaron la arena del Circo romano. También supervisó los trabajos en el terreno que hoy ocupa el centro comercial Parc Central, donde se descubrió una importante basílica paleocristiana.

Rodolfo Cortés fue Titular de Universidad desde 1985 hasta su jubilación en 2007. Posteriormente, fue nombrado profesor emérito de la URV hasta 2013, una distinción que reconocía los servicios destacados prestados a la institución y que le permitió seguir colaborando en tareas de docencia e investigación.