L'incident ha tingut lloc quan el comboi, que transportava aproximadament 150 passatgers, ha col·lidit amb un arbre que havia caigut sobre la via. Afortunadament, el xoc no ha provocat cap ferit entre els ocupants del tren, segons han confirmat els serveis d'emergència.

Immediatament després de l'impacte, s'han activat els protocols d'emergència i els serveis de rescat han començat l'evacuació dels passatgers. Set dotacions dels Bombers de la Generalitat s'han desplaçat al lloc dels fets per assistir en les tasques. Els viatgers han estat acompanyats a peu per la carretera GIV 62-33 fins a un punt on han pogut agafar autobusos amb destinació a Figueres.

Per minimitzar les afectacions a la mobilitat, Renfe ha organitzat un servei alternatiu per carretera entre Flaçà i Figueres. A més, s'ha habilitat un servei especial Avant des de l'estació de Sants de Barcelona, amb parades a Girona i Figueres, i un tren de reforç en sentit contrari per garantir la continuïtat del servei.

La situació ha portat a Protecció Civil a activar el pla Ferrocat en fase d'alerta, un protocol que es posa en marxa davant d'incidents ferroviaris per coordinar l'actuació dels diferents cossos d'emergència i garantir la seguretat dels afectats.